果蠅腦

Neuron Navigator (NNG)

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現在的尖端顯微鏡技術，已經可以產出大量前所未見的清晰神經元影像。但要如何從這些影像中找出關聯性，已對現在的電腦科技產生新的挑戰。例如，要如何找出神經元的聯結關係，這是一個了解腦內部如何傳遞和處理資訊的一個重要關鍵。

我們發展出一套新的系統，Neuron Navigator (NNG)，它整合了一個三維腦神經元影像資料庫，並加上功能強大的使用者介面，來幫助研究學者分析並觀察腦神經元連結關係，並發現可能的傳遞路徑。

NNG 除了可以搜尋神經元彼此聯結關係，並可以找出通過某個空間區域的神經元。並可以把多個條件合併搜尋。現在 NNG 實際應用於果蠅腦神經元影像。

如要實際操作，可以到 http://211.73.64.34/NNG，註冊後就可以使用；操作影片請見本文底部連結。

（本研究成果已被 PacificVis 2011 所接受，PDF）

201205 更新：已新開發出神經元聯結路徑搜尋功能，及以神經元連結的 2D Connectivity Graph 顯示功能；並在2012年5月於 The 6th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2012) 發表。

Videos:

1. Single Object Query
2. And Query
3. Intersection Query
4. Across Query
5. Innervation Query
6. Density Map
7. Path Query
8. 2D Connectivity Graph

果蠅腦（Fly Brain）

果蠅腦神經之三維影像視覺化應用。此為清華大學腦科學研究中心、美國冷泉港實驗室與國網中心之合作計畫。本計畫執行過程中，需要將三維影像切片之果蠅腦資料視覺化。

國網中心視算與互動媒體實驗室，分別以網格與容積資料顯像（Volume Rendering）技術，對果蠅腦之神經網路與功能區塊加以呈現。於 2007 年，更開發出多層次精細度（Level-Of-Detail）容積顯像技術，使近景精細而遠景粗糙，讓系統在有限資源下，依然能提供即時互動的導覽功能，同時呈現高解析度果蠅腦影像。