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醫學視覺化

目錄

  • 人腦神經纖維束(Human Brain and Neural Tracts)
    • 中文說明
    • English Description
    • 資源
  • Medical Image Illustrator (MIIL)
  • 人體動脈瘤電腦斷層資料(Aneurysm CT)
  • 睡眠障礙風險評估平台
  • 血管流場模擬(Blood Flow)
  • 人體氣管重建(Reconstruction of Human Trachea)
  • 人體腦部電腦斷層資料(Human Brain CT)
  • 肺癌電腦斷層資料(Lung Cancer CT)
  • Nvidia GTC 2020 三維醫療影像視覺化成果分享

人腦神經纖維束(Human Brain and Neural Tracts)

中文說明

人腦核磁共振攝影(MRI)影像與神經纖維束的整合顯示。此為生醫中心、臺大醫院影像醫學部與國網中心視算與互動媒體實驗室的合作計畫。

在本計劃中,先將腦部白質、腫瘤的部分以影像處理的方式找出其大致的輪廓,並將腫瘤、人腦的 MRI 影像和神經纖維束的資料,個別以不同的技術,同時呈現在畫面中。同時,也引入了 splitting-plane 等技術,來加強在視覺上的呈現效果;如此,也能使用各種不同角度來觀察,讓醫師充分的瞭解各種神經束和腫瘤間的關係,在術前擬定完整的手術計畫,儘可能地切除腫瘤,同時避免對神經纖維束造成不必要的損傷。

腦瘤、人腦、神經的混合顯示。黃色部分為腦瘤、紅色為腦部白質、線條為神經纖維束
A snap shot of tumor, brain and fibers image fusion visualization. The yellow object is the tumor, the pink object is the brain and the colorful lines are the tracts.

English Description

This is a collaborative work among Biomedical Science Park Administrator, National Taiwan University Hospital (NTUH) and National Center for High-performance Computing (NCHC).

The medical doctors intend to visualize the MRI image data of a human brain coupled with the neural fibers. The visualization and interactive media lab at NCHC processes the DICOM data from several medical imaging modalities, and segments the brain white matter tissue, tumor, and tracts. The displayed image below requires a image fusion process and has applied splitting-plane to enhance the visual effect. This 3D interactive visualization application allows the surgeons to have a better understanding of the patient before the operation.

資源

  • 立體影片下載 | Stereo Movie Download
  • 互動操作的觀察,可以參考 Virtual Object Viewer 操作的版本。
    (注意:需要較高的網路頻寬方可較順暢的操作)

Medical Image Illustrator (MIIL)

使用 3D VR Engine 與 IMT 工具程式庫開發出來之應用程式。

可以處理醫療影像 DICOM 格式,並藉由二維與三維之呈現與量測工具,協助醫師進行診療與手術規劃。

更多說明請點擊這裡。

人體動脈瘤電腦斷層資料(Aneurysm CT)

動脈瘤視覺化展示。資料來源為 OsiriX 所提供的公開樣本資料,所使用的是名為「PANORAMIX」的腹腔資料。本展示是腹腔中各個組織強化與標示後之視覺化結果,也能驗證我們開發之 Segmentation 功能。

人體腹腔之 Volume Rendering 顯示,圖中紅色突起之部位為血管瘤

互動操作的觀察,可以參考 Virtual Object Viewer 操作的版本。
(注意:需要較高的網路頻寬方可較順暢的操作)

睡眠障礙風險評估平台

最早是在 2007、2008 年的時候,「醫療計算工程模擬組」合作的軟體,後來醫工組那時候還與長庚醫院的醫師一起開了記者會。vimL 一直是背後負責提供影像處理工具與資料視覺化功能。這次因為海昌公司有完整的規劃,知道如何應用這個平台推展他們的商業模式運作,所以技轉與後續服務一次談成。算是中心第一次與商業公司技轉合作的成功案例吧。

系統架構圖

vimL 團隊使用 IMT 以及 RIV 的技術,開發出網頁版的呼吸道半自動圈選平台、可以由電腦斷層影像產生出流體力學模擬所需要的呼吸道 3D 模型。

呼吸道切割、模型重建示意圖˙

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人體肺部的氣管網格(Mesh)重建

人體腦部電腦斷層資料(Human Brain CT)

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結合三個軸的 2D 電腦斷層影像顯示與 3D Volume Rendering
人體腦部電腦斷層 3D Volume Rendering 影像
使用不同 Transfer function 的人體腦部 Volume Rendering 影像

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本展示以容積資料顯像技術清楚顯示骨架、肺部、氣管與肺癌,並提供三維空間中正確相對位置關係。

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Nvidia GTC 2020 三維醫療影像視覺化成果分享

Nvidia GTC 2020

這場演講會介紹國家實驗研究院國家高速網路與計算中心的科學視算與互動多媒體實驗室團隊 (VIML) 在生物醫療影像相關領域的成果。首先是 MiiL 這套團隊開發的醫療影像處理軟體,以自有的影像處理程式庫與三維視覺化引擎結合加上使用者界面,能夠針對灰階 / 彩色等影像套用不同的二三維影像處理演算法以進行標記切割量測等動作,然後輸出至 VIML 開發的三維醫療影像導覽程式 vvViewer 在 VR 環境內進行互動。另外 VIML 團隊也參與了呼吸中止症的判斷系統,在前端負責影像的標記與後端的負責將模擬後的氣管資料利用 GPU 進行視覺化與統計分析,以產出最後的分析報告。

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