Skip to content
vimL Blog
viml@nchc.org.twviml@nchc.org.tw
  • 研究
    • 成果
      • 生物資訊視覺化
        • 果蠅腦
        • 老鼠相關研究
        • 其他
      • 醫學視覺化
      • 科學計算視覺化
      • 地理資訊視覺化
      • AI 相關
      • 其他
    • 函式庫
    • 軟體
      • MiiL : Medical Image Illustrator
      • vimL VR Viewer
      • OpenNI Related
    • 網站系統
      • iFlyOver
      • Remote Interactive Viewer
      • Virtual object Viewer
    • 論文
    • 活動
  • 成員名單
  • 課程
    • MiiL & vvViewer
    • OpenGL 相關
    • OpenNI
  • 部落格
  • 外部連結
  • 下載
  • NCHC
Close Menu

果蠅腦

Neuron Navigator (NNG)

中文版

現在的尖端顯微鏡技術,已經可以產出大量前所未見的清晰神經元影像。但要如何從這些影像中找出關聯性,已對現在的電腦科技產生新的挑戰。例如,要如何找出神經元的聯結關係,這是一個了解腦內部如何傳遞和處理資訊的一個重要關鍵。

我們發展出一套新的系統,Neuron Navigator (NNG),它整合了一個三維腦神經元影像資料庫,並加上功能強大的使用者介面,來幫助研究學者分析並觀察腦神經元連結關係,並發現可能的傳遞路徑。

NNG 除了可以搜尋神經元彼此聯結關係,並可以找出通過某個空間區域的神經元。並可以把多個條件合併搜尋。現在 NNG 實際應用於果蠅腦神經元影像。

如要實際操作,可以到 http://211.73.64.34/NNG,註冊後就可以使用;操作影片請見本文底部連結。

(本研究成果已被 PacificVis 2011 所接受,PDF)

201205 更新:已新開發出神經元聯結路徑搜尋功能,及以神經元連結的 2D Connectivity Graph 顯示功能;並在2012年5月於 The 6th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE 2012) 發表。

Videos:

  1. Single Object Query
  2. And Query
  3. Intersection Query
  4. Across Query
  5. Innervation Query
  6. Density Map
  7. Path Query
  8. 2D Connectivity Graph

果蠅腦(Fly Brain)

果蠅腦神經之三維影像視覺化應用。此為清華大學腦科學研究中心、美國冷泉港實驗室與國網中心之合作計畫。本計畫執行過程中,需要將三維影像切片之果蠅腦資料視覺化。

國網中心視算與互動媒體實驗室,分別以網格與容積資料顯像(Volume Rendering)技術,對果蠅腦之神經網路與功能區塊加以呈現。於 2007 年,更開發出多層次精細度(Level-Of-Detail)容積顯像技術,使近景精細而遠景粗糙,讓系統在有限資源下,依然能提供即時互動的導覽功能,同時呈現高解析度果蠅腦影像。

使用網格(Mesh)呈現果蠅腦部各功能區塊
使用 Volume Rendering 呈現果蠅部份區塊與腦部神經
使用 Level-Of-Detail Volume Rendering 呈現高解析度果蠅腦資料
使用 splitting-plane 進行高解析度果蠅腦資料觀察
更換不同顏色與光影之顯像結果

分類

  • 心得感想
    • 工作
    • 美食
  • 技術相關
    • 技術研究
    • 新奇玩意
  • 本站公告
    • What's New
  • 輕鬆一下

近期文章

  • Meta Quest 2 Elite 頭帶送修紀錄
  • HTC Vive Pro 2 使用紀錄
  • HTC Vive Pro 2 開箱
  • C++ 字串轉 chrono 的 time_point
  • GitLab 推出 CLI 工具以及新版 Web IDE:15.7 更新

近期留言

  1. 「Heresy」於〈Visual Studio 2022 17.2 正式推出〉發佈留言
  2. 「Septemhill」於〈簡易的程式平行化-OpenMP(五) 變數的平行化〉發佈留言
  3. 「heresy」於〈簡易的程式平行化-OpenMP(五) 變數的平行化〉發佈留言
  4. 「铁血丹心」於〈簡易的程式平行化-OpenMP(五) 變數的平行化〉發佈留言
  5. 「heresy」於〈簡易的程式平行化-OpenMP(五) 變數的平行化〉發佈留言

標籤雲

 Docker  HTC Vive  HTC Vive Focus  HTC Vive Pro  MR  Oculus Quest 2  Oculus Rift S  OpenVR  Valve Index  Windows MR 3d print 3D立體 Boost C++ C++11 C++14 C++17 C++20 CubeX CUDA git GitLab HoloLens 2 HTC Vive javascript Kinect MiiL NiTE2 Oculus OpenCL OpenCV OpenGL OpenMP OpenNI OpenNI2 OpenXR Python Qt VisualStudio VR WIndows 11 WSA WSL 課程 資料視覺化

Software Company WordPress Theme © Visualization and Interactive Media Laboratory of NCHC, 2007 - 2021, All Rights Reserved